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色譜研究進(jìn)展及在組學(xué)中的應(yīng)用

更新時(shí)間:2015-05-11      點(diǎn)擊次數(shù):1452
導(dǎo)讀] 在第二十屆全國色譜學(xué)術(shù)報(bào)告會及儀器展覽會上,來自于中國科學(xué)院大連化學(xué)物理研究所的張玉奎院士向到場的嘉賓和觀眾介紹了色譜技術(shù)近年來的發(fā)展?fàn)顩r以及在代謝組學(xué)中的應(yīng)用,并與現(xiàn)場嘉賓和觀眾進(jìn)行了交流。  第二十屆全國色譜學(xué)術(shù)會議于4月19日在西安曲江學(xué)術(shù)會議中心順利召開,來自于國內(nèi)外上千名的專家學(xué)者匯聚于此分享著在色譜領(lǐng)域中的研究成果和進(jìn)展。在此次會議上,來自于中國科學(xué)院大連化學(xué)物理研究所的張玉奎院士向到場的嘉賓和觀眾介紹了色譜技術(shù)近年來的發(fā)展?fàn)顩r以及在代謝組學(xué)中的應(yīng)用,并與現(xiàn)場嘉賓和觀眾進(jìn)行了交流。 張玉奎談到,我國作為目前世界經(jīng)濟(jì)和增長速度zui快的國家之一,面臨著資源、環(huán)境、人口與健康、社會可持續(xù)發(fā)展等諸多挑戰(zhàn),色譜科學(xué)和技術(shù)在解決這些重大問題中正在發(fā)揮越來越重要的作用。近兩年來,我國色譜學(xué)科在色譜理論研究、多維色譜儀器、新型色譜填料和色譜柱、樣品前處理方法、應(yīng)用領(lǐng)域等方面得到了突飛猛進(jìn)的發(fā)展。新型親水色譜柱、整體材料色譜柱、手性分離色譜柱等層出不窮。開發(fā)了包括攪拌棒吸附萃取技術(shù)在內(nèi)的微型化處理技術(shù)、親和色譜在內(nèi)的選擇性預(yù)處理技術(shù)、在線連用的柱上堆積富集技術(shù)等。針對復(fù)雜樣品的分離分析構(gòu)建了全二維氣相色譜、多維液相色譜、多維毛細(xì)管電泳等多維分離系統(tǒng)。色譜的應(yīng)用領(lǐng)域也在不斷擴(kuò)大,尤其是在與生命科學(xué)和環(huán)境科學(xué)密切相關(guān)的代謝組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、中藥分離分析、環(huán)境分析等領(lǐng)域發(fā)揮越來越重要的作用。中國科學(xué)院大連化學(xué)物理研究所 張玉奎院士  接下來,張玉奎就人類蛋白組學(xué)2014年的研究進(jìn)展做了介紹。2014年,來自約翰霍普金斯大學(xué)的蛋白質(zhì)組研究員Akhilesh Pandey,與來自印度生物信息學(xué)研究所等處的研究人員合作,分析了30種不同的組織類型,編撰了由84%所有預(yù)期編碼蛋白的人體基因翻譯得到的蛋白。這項(xiàng)研究識別出17, 294個(gè)蛋白編碼基因,并通過表達(dá)分析證明了組織和細(xì)胞特異性蛋白的存在,并且研究人員還通過從注解的假基因、非編碼RNA和未翻譯的區(qū)域識別翻譯的蛋白,表明了“蛋白基因組"分析的重要性。同時(shí),來自德國研究人員慕尼黑工業(yè)大學(xué)的Bernhard Küster等人創(chuàng)新性的推出了一個(gè)搜索性公共數(shù)據(jù)庫:ProteomicsDB,這一數(shù)據(jù)庫公布了18, 097個(gè)基因獲得的蛋白,占目前預(yù)計(jì)人類蛋白總數(shù)(19, 629)的92%。這種數(shù)據(jù)能用于識別數(shù)百個(gè)翻譯的lincRNAs,對藥物敏感的標(biāo)記,以及用于發(fā)現(xiàn)mRNA和組織中的蛋白水平之間的定量關(guān)系等。這兩個(gè)研究組都利用了質(zhì)譜方法分析人類組織,Pandey研究組分析的是全新的數(shù)據(jù),針對了多種不同健康人體組織的數(shù)據(jù),其中包括七種胎兒組織和六種血細(xì)胞類型。而Küster研究組則采用了稍微有些不同的方法,他們匯集了已有質(zhì)譜分析數(shù)據(jù),以及同事的一些成功,這些大約占據(jù)ProteomicsDB數(shù)據(jù)的60%。為了填補(bǔ)這些數(shù)據(jù)間的空白區(qū)域,Küster實(shí)驗(yàn)室構(gòu)建了自己的質(zhì)譜數(shù)據(jù),分析了60個(gè)人類組織體液,13個(gè)體液,以及147個(gè)的癌細(xì)胞系。接著,張玉奎介紹了中科院大連化學(xué)物理研究所,近年來在蛋白組學(xué)研究上的一些進(jìn)展,如由鄒漢法主持的國家重大科學(xué)研究計(jì)劃《修飾蛋白質(zhì)規(guī)?;蛛x鑒定新技術(shù)新方法》(S973),張麗華主持的國家重大科學(xué)研究計(jì)劃《蛋白質(zhì)定量新方法及相關(guān)技術(shù)研究》(S973),梁鑫淼主持的863《蛋白質(zhì)組技術(shù)與分子標(biāo)志物研發(fā)》項(xiàng)目課題三《糖蛋白與糖鏈結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)與應(yīng)用研究》,許國旺主持的國家科技重大專項(xiàng)病毒性肝炎相關(guān)肝癌發(fā)生發(fā)展的代謝特征和個(gè)性化用藥研究》等。  zui后,張玉奎講到,在蛋白質(zhì)組學(xué)研究中,蛋白質(zhì)的分離和鑒定依然是目前zui基本的任務(wù)和目標(biāo)。隨著蛋白質(zhì)組學(xué)研究的不斷深入,蛋白質(zhì)分離鑒定技術(shù)將得到更加廣泛的關(guān)注。新型的高通量、高靈敏多維分離鑒定技術(shù)的發(fā)展,例如集成化蛋白分析平臺,芯片多維液相色譜等,將為蛋白組研究帶來新的革命。

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